الوقف يعمل كمنظمة مستقلة تماما ومسؤولة عن زيادة إيراداتها الخاصة. في السنوات الأولى من بدء عملياته، تلقى الوقف مجمل تمويله من مؤسسة "ماكات إنترناشيونل" (MACAT International)، وهي مؤسسة تعليمية أسسها رجل الأعمال صلاح خليل، وتقوم بقيادة عملية تطوير مكتبة رقمية تفاعلية ستشتمل على تحليلات نقدية لنحو 5000 عمل أكاديمي مؤثر تغطي 14 مادة دراسية مختلفة في العلوم الاجتماعية من خلال منصة متكاملة متعددة الوسائط.
ومن الممولين الرئيسيين الآخرين: مؤسسة فورد، ومؤسسة كارنيجي كوربورايشن، والصندوق العربي للإنماء الاقتصادي والاجتماعي وصندوق الأمم المتحدة للديموقراطية ومركز السلطان قابوس العالي للثقافة والعلوم ومؤسسات المجتمع المفتوح والمحسن اللبناني جورج فرحة.
ويقوم الوقف حاليا بدراسة ووضع خطط لتطوير قدرته في جمع التبرعات في الولايات المتحدة وبريطانيا والدول العربية. ويسعى للحصول على تمويل من مجموعة متنوعة من الجهات المانحة مثل: